.. _intro-FAQs:

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常见问题解答
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1. VMD中轨迹中键显示不正确，怎么处理？
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加载GROMACS的.gro和.xtc文件时，结构文件如下图所示：



.. image:: /_static/bonderror2024-09-24_145549.648812.bmp
	:align: center

键的显示不正确，可能是由于周期性边界条件（PBC）导致的。
当分子或体系跨越了周期性边界框时，VMD会错误地根据原子间的距离猜测键，从而导致键线杂乱。
解决方法：

在VMD的命令行窗口，输入下面命令进行修正修正周期性边界。

.. code-block:: console

  pbc unwrap -sel "all"


.. image:: /_static/pbc2024-09-24_144533.580901.png
	:align: center


这个命令会解开所有原子，使它们不再跨越周期性边界，避免错误的键线显示。


.. image:: /_static/pbcview2024-09-24_145828.561204.png
	:align: center